Buena pregunta, y la respuesta es: sí... pero no tanto como podrías pensar. Vamos por partes:

Similitudes entre lituano y letón:
Ambos son idiomas bálticos, una rama muy antigua y poco común dentro de la familia indoeuropea.
Comparten raíces lingüísticas profundas, estructuras gramaticales complejas y una evolución lenta. Por ejemplo, el lituano ha conservado muchas características del protoindoeuropeo.
Ambos tienen casos gramaticales (como el latín o el ruso) y declinaciones, aunque en diferente número.

Diferencias importantes:
Mutuamente ininteligibles: un lituano no entiende a un letón al escucharlo, y viceversa.
Fonética y entonación bastante distintas.
Vocabulario compartido, pero también muchas palabras completamente diferentes.
El lituano es más conservador lingüísticamente (más cercano al protoindoeuropeo), mientras que el letón ha cambiado más con los siglos.

Una comparación útil:
Es como si compararas el español y el italiano. Hay raíces comunes, gramáticas similares, pero no puedes entender uno si solo hablas el otro... y esas lenguas son incluso más cercanas que letón y lituano.
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Así que: primos lejanos, sí. ¿Casi iguales? No. ¿Exóticos y f
ascinantes? Definitivamente.